El corazón de la historia late gracias a Miles Morales, un adolescente de Brooklyn que lucha por encontrar su lugar en el mundo mientras lidia con las expectativas de su padre policía y su fascinación por su tío Aaron. A diferencia de Peter Parker, Miles aporta una sensibilidad cultural diversa y una conexión con el arte del graffiti que define toda la estética visual de la cinta. Cuando Miles es mordido por una araña radiactiva y presencia la muerte del Spider-Man de su dimensión, se ve obligado a cargar con un legado para el que no se siente preparado.